Показываю на примере usb-flash, для внутренних и внешних жестких дисков — аналогично.

Для начала нужно посмотреть «название» флешки в системе командой: sudo fdisk -l (подробнее про fdisk можно почитать здесь: )

Среди информации обо всех дисках, наверняка увидите и вашу флешку (например, по объему она будет явно отличаться от жестких дисков).

Если флешка примонтировалась автоматически, то сначала нужно её отмонтировать:

sudo umount /dev/sdX

Форматируем в fat:

sudo mkfs.vfat /dev/sdX

#где sdX — ваша флешка (например sdb1).

Форматируем в ext2:

sudo mkfs.ext2 /dev/sdX

Форматируем в ext3:

sudo mkfs.ext3 /dev/sdX

Форматируем в ext4:

sudo mkfs.ext4 /dev/sdX

Форматируем в MSDOS:

sudo mkfs.msdos /dev/sdX

Форматируем в ReiserFS:

sudo mkfs.reiserfs /dev/sdX

Форматируем в NTFS:

sudo mkfs.ntfs /dev/sdX